実験１では用語ベクトルに対してベクトル空間法を実行したが、ここでは5.1.2 節で作成した近似行列に対して行った。その後、実験１と同様に類似度に0.1以上の差があればモード法によって２値化を行うことにした。プログラムはコマンドライン上から実行することを想定しており、2値化の有無を設定出来るようになっている。 今回ベクトル空間法を行った結果を表 5.2に示す。この表は複合語無・重要度有時の3Eプログラミングの類似度計算結果であり、ここでは4Eデータ構造とアルゴリズムと2Eのプログラミングの類似度差が0.1を越えているので、3Eプログラミング、2Eプログラミング、4Eデータ構造とアルゴリズムが評価対象となる。類似度の大きさは実験１とは大分異なっており、表と合わせて見ればそれがよく分かる。
| 教科名 | 3Eプログラミングに対する類似度 |
| 3Eプログラミング | 1.000000 |
| 4Eデータ構造とアルゴリズム | 0.747915 |
| 2Eプログラミング | 0.396136 |
| 4E情報工学実験 | 0.288584 |
| 4E情報理論 | 0.267316 |
| 5Eコンパイラ | 0.186127 |
| 5E応用物理 | 0.139631 |
| 5Eソフトウェア工学 | 0.117822 |
| 5Eシステム工学 | 0.112716 |